Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RASSF3Q86WH2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RASSF3Q86WH2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms