Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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HAPLN4Q86UW8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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HAPLN4Q86UW8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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