Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AC010894.2-201ENST00000444196 561 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CEP350Q5VT06 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP350Q5VT06 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms