Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms