Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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PITRM1Q5JRX3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PITRM1Q5JRX3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PITRM1Q5JRX3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PITRM1Q5JRX3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PITRM1Q5JRX3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PITRM1Q5JRX3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PITRM1Q5JRX3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PITRM1Q5JRX3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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