Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms