Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN20Q4JDL3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms