Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC5A12Q1EHB4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC5A12Q1EHB4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms