Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPPQ16740 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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