Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN3Q16667 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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