Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CTF1Q16619 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CTF1Q16619 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CTF1Q16619 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CTF1Q16619 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CTF1Q16619 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CTF1Q16619 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CTF1Q16619 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CTF1Q16619 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CTF1Q16619 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CTF1Q16619 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CTF1Q16619 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CTF1Q16619 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CTF1Q16619 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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