Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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GRIK5Q16478 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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GRIK5Q16478 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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GRIK5Q16478 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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GRIK5Q16478 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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