Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABRA6Q16445 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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