Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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