Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP13Q15645 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms