Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERC3Q15034 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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