Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms