Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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