Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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