Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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