Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA7Q13683 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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