Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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