Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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