Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms