Protein–RNA interactions for Protein: Q13068

GAGE4, G antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE4Q13068 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GAGE4Q13068 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms