Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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