Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXC1Q12948 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FOXC1Q12948 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FOXC1Q12948 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FOXC1Q12948 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FOXC1Q12948 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FOXC1Q12948 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FOXC1Q12948 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FOXC1Q12948 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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FOXC1Q12948 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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FOXC1Q12948 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXC1Q12948 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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