Protein–RNA interactions for Protein: Q12882

DPYD, Dihydropyrimidine dehydrogenase [NADP(+)], humanhuman

Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPYDQ12882 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DPYDQ12882 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms