Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms