Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms