Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms