Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN1BQ07699 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms