Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREMQ03060 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms