Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms