Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms