Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSG1Q02413 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms