Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms