Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAP1Q01518 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms