Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TFAMQ00059 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms