Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD3P84022 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms