Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms