Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms