Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms