Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TTPAP49638 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TTPAP49638 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTPAP49638 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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