Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN2P35609 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms