Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GPC1P35052 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms