Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms