Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMBRP28336 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMBRP28336 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NMBRP28336 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms