Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LMO1P25800 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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