Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA4P25789 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA4P25789 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms